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人目標(biāo)區(qū)域測序分析

產(chǎn)品簡介

人目標(biāo)區(qū)域測序(Target Region Sequencing, TRS)是將感興趣的人類基因組區(qū)域通過探針或者擴(kuò)增富集后再進(jìn)行測序的研究方法。該方法能夠獲得指定目標(biāo)區(qū)域的序列信息,范圍小,深度高,可顯著降低研究成本,極大地提高了特定目標(biāo)區(qū)域的研究效率。

韋翰斯生物目前可提供捕獲探針富集、多重PCR富集和Long-PCR富集三種方法,客戶只需提供目標(biāo)區(qū)域和要求,我們即可根據(jù)要求和研究目的,為客戶選擇和定制最佳的方案。



技術(shù)路線




數(shù)據(jù)分析

標(biāo)準(zhǔn)分析

1.數(shù)據(jù)質(zhì)控:去除接頭污染和低質(zhì)量數(shù)據(jù)
2.與參考序列進(jìn)行比對、統(tǒng)計測序深度及覆蓋度
3. SNP/InDel檢測、注釋及統(tǒng)計

高級分析

(一)基于變異有害性的篩選
1.突變位點(diǎn)篩選
2.Non-coding區(qū)突變位點(diǎn)篩選
(二)基于選樣信息的篩選
1.突變位點(diǎn)篩選(散發(fā)樣本)
(三)基于統(tǒng)計學(xué)檢驗(yàn)的顯著性分析(成對樣本)
1.位點(diǎn)顯著性分析
2.基因顯著性分析

(四)個性化分析

根據(jù)客戶要求進(jìn)行個性化分析


案例展示

Mutational spectrum of Chinese LGMD patients by targeted next-generation sequencing

目標(biāo)區(qū)域測序研究中國肢帶型肌營養(yǎng)不良患者突變譜

北京大學(xué)第一醫(yī)院的研究團(tuán)隊在《PLOS ONE》上發(fā)表文章,闡述了目標(biāo)區(qū)域靶向捕獲測序在肢帶型肌營養(yǎng)不良癥(LGMD)中的診斷價值,并研究了中國LGMD患者的突變譜。

研究人員使用定制的包含420個基因的靶向捕獲Panel,對180名患者進(jìn)行測序。測序結(jié)果表明,180名患者中共有123名具有致病性突變,遺傳診斷陽性率為68.3%。研究人員表明,NGS結(jié)合臨床及肌病理學(xué)評估,可大大提高LGMD的分子診斷率。


Yu Meng,Zheng Yiming,Jin Suqin et al. Mutational spectrum of Chinese LGMD patients by targeted next-generation sequencing.[J] .PLoS ONE, 2017, 12: e0175343.




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