甲基化測序分析
產(chǎn)品簡介
甲基化測序是指通過bisulfite轉(zhuǎn)化后再進行測序的方法。除可以對全基因組甲基化進行測序和研究外,還可以對特定目標(biāo)區(qū)域或特定基因進行測序和研究。與芯片方法相比,利用測序方法進行甲基化研究,通量高,成本低,可達到單堿基分辨率,適用于對已知的感興趣區(qū)域進行高深度甲基化檢測驗證和新的甲基化位點挖掘,該技術(shù)使得對全基因組內(nèi)感興趣的目標(biāo)序列和區(qū)域進行高通量高精度的甲基化檢測成為現(xiàn)實,在甲基化組學(xué)研究方面提供了一個全方位,穩(wěn)定高效,高性價比的技術(shù)方法。
全基因組重亞硫酸鹽測序(whole genome bisulfite Sequencing,WGBS),通過重亞硫酸鹽對樣本DNA進行處理,通過高通量測序技術(shù),可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。此外,還可以通過對目標(biāo)區(qū)域進行測序,從而獲得目標(biāo)區(qū)域的甲基化狀態(tài),目標(biāo)明確,性價比高。
技術(shù)路線

數(shù)據(jù)分析
原始數(shù)據(jù)質(zhì)控評估
|
參考基因組比對分析統(tǒng)計
|
C堿基甲基化水平分析
|
基因組不同區(qū)域和各功能原件甲基化水平分析
|
差異甲基化區(qū)域分析(DMR)
|
DMR區(qū)域基因注釋
|
組間差異甲基化GO功能分析
|
組間差異甲基化Pathway功能分析
|
案例展示
Environment‐induced epigenetic reprogramming in genomic regulatory elements in smoking mothers and their children
孕婦吸煙可對后代甲基化產(chǎn)生長期影響
孕婦身體狀況對于胎兒健康有著重要影響,如果孕婦抽煙,對后代是否也有影響?來至德國的研究團隊,從表觀遺傳學(xué)的角度告訴了我們孕期吸煙對新生兒所帶來的影響,包括DNA甲基化、組蛋白修飾,并從轉(zhuǎn)錄組水平對其進行了驗證。
為了確定到底是孕期抽煙還是遺傳因素造成的差異,在進行全基因組甲基化測序(WGBS)數(shù)據(jù)處理時,研究人員將遺傳導(dǎo)致的DMR(gDMR)和非遺傳因素導(dǎo)致的DMR(ngDMR)區(qū)分開來進行分析,即排除了遺傳因素干擾后,研究了吸煙對新生兒DNA甲基化的影響。研究人員還對這部分新生兒4歲后進行了跟蹤檢測,研究結(jié)果表明,吸煙對新生兒DMR的影響是長期性的,這部分結(jié)果在大鼠模型中也作了驗證。

Bauer T, Trump S, Ishaque N, et al. Environment‐induced epigenetic reprogramming in genomic regulatory elements in smoking mothers and their children[J]. Molecular systems biology, 2016, 12(3).